离心机转子是离心机分离样品的核心部件，它的转速与转头的材料及强度有关。要达到良好的分离效果，转头的选择非常重要。离心机转子有两种常见类型，分别是角转子和水平转子。

角转子（定角转头）：在离心过程中，离心管与轴之间的角度是固定的，通常在14到45之间。离心时，样品会首先沉淀到离心管侧壁，然后下滑至离心管的外侧底部聚集。定角转头的沉降效率高，有非常好的适用性，容量范围也很广。主要用于各种不同体积的样品的沉淀离心，定角转头是应用最广泛的转头。

水平转子：又称甩平转头、荡平转头。转头静止时，处于转头中的离心管中心线与旋转轴平行。转头旋转加速时，离心管中心线由平行位置逐渐过渡到垂直位置，即与旋转轴成90角。该类型转子主要用于样品做密度梯度离心。颗粒移动距离长，相应离心时间一般也较长，溶液中的组分相对于管壁的位置在离心过程中和离心后不发生改变，因此离心效果好，但因颗粒在离心场中是从旋转中沿径向散离出去，而不是按相互平行的路线沉降。颗粒碰到外壁沿着管壁滑到管底，因此也会产生对流，但比固定角转子小。低速启动或停机时会产生振动，影响分离效果。